Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Scamp4Q9JKV5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp4Q9JKV5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms