Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmx1aQ9JKU8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmx1aQ9JKU8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms