Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Habp4Q9JKS5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Habp4Q9JKS5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms