Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nova1Q9JKN6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nova1Q9JKN6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms