Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms