Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pard6bQ9JK83 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms