Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms