Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nrip3Q9JJR9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrip3Q9JJR9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms