Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ercc6l2Q9JIM3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ercc6l2Q9JIM3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ercc6l2Q9JIM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms