Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc22Q9JIG7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc22Q9JIG7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms