Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms