Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HpgdsQ9JHF7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HpgdsQ9JHF7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms