Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tcirg1Q9JHF5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms