Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rb1cc1Q9ESK9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms