Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ropn1Q9ESG2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ropn1Q9ESG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms