Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp29Q9ES63 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp29Q9ES63 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp29Q9ES63 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Usp29Q9ES63 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp29Q9ES63 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp29Q9ES63 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp29Q9ES63 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp29Q9ES63 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp29Q9ES63 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms