Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3bQ9ES34 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3bQ9ES34 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3bQ9ES34 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms