Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ripk4Q9ERK0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ripk4Q9ERK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms