Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc28a3Q9ERH8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms