Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tfcp2Q9ERA0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tfcp2Q9ERA0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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