Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cyp3a44Q9EQW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp3a44Q9EQW4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms