Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnn1Q9EQR3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnn1Q9EQR3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms