Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r48Q9EQ52 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms