Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcr6Q9EQ16 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcr6Q9EQ16 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcr6Q9EQ16 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cxcr6Q9EQ16 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cxcr6Q9EQ16 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cxcr6Q9EQ16 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cxcr6Q9EQ16 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr6Q9EQ16 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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