Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SgshQ9EQ08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SgshQ9EQ08 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms