Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ropn1lQ9EQ00 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ropn1lQ9EQ00 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms