Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl4Q9DCU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl4Q9DCU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl4Q9DCU6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl4Q9DCU6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms