Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CrotQ9DC50 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CrotQ9DC50 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms