Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syde1Q9DBZ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syde1Q9DBZ9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms