Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cbx6Q9DBY5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cbx6Q9DBY5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms