Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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Smg9Q9DB90 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg9Q9DB90 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Smg9Q9DB90 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Smg9Q9DB90 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Smg9Q9DB90 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Smg9Q9DB90 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Smg9Q9DB90 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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Smg9Q9DB90 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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