Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fundc1Q9DB70 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fundc1Q9DB70 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms