Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ap1s2Q9DB50 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms