Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pop5Q9DB28 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pop5Q9DB28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms