Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cmtm2aQ9DAR1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmtm2aQ9DAR1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms