Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DAE8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9DAE8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9DAE8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms