Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmbim4Q9DA39 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmbim4Q9DA39 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms