Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Actrt1Q9D9J3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Actrt1Q9D9J3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms