Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tbc1d20Q9D9I4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tbc1d20Q9D9I4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms