Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldnd2Q9D9H2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldnd2Q9D9H2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms