Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg7Q9D906 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atg7Q9D906 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms