Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlirpQ9D8T7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlirpQ9D8T7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms