Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms