Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D8N1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D8N1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms