Protein–RNA interactions for Protein: Q9D848

AY761184, CRS1C-3, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761184Q9D848 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AY761184Q9D848 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms