Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp4cQ9D7F7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms