Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F2

Lypd6b, Ly6/PLAUR domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd6bQ9D7F2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lypd6bQ9D7F2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lypd6bQ9D7F2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.1 ms