Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gbe1Q9D6Y9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbe1Q9D6Y9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms