Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip1Q9D620 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip1Q9D620 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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