Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc130Q9D516 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc130Q9D516 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms